デルタ株、ラムダ株
デルタ株やラムダ株とは何者か?元のウイルスからどう変異しているのか?
新型コロナウイルスのゲノム
新型コロナウイルスは正式にはSARS-Cov-2とよばれるRNAウイルスで、ゲノムサイズは29903塩基。配列情報は各種DBで参照できる。DDBJはこちら↓
このうち、21563~25384番の部分が感染性の鍵になるスパイクタンパクに対応する領域で、アミノ酸長でいえば1273個となる。
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様々な変異によりいろいろな位置のアミノ酸が別のものに置き換わっているが、そのなかでも452番目のL(赤字、ロイシン)が割と肝のようで、デルタ株ではこれがR(アルギニン)に変異している。またラムダ株はこれがQ(グルタミン)に変異している(L452R、L452Qとよばれているのがこれである)。このほかにも何カ所かで変異があるものがある。
ワクチンのmRNA塩基配列
こうなると、モデルナやファイザーのワクチンのmRNA塩基配列が気になってくるが、いずれのワクチンも塩基配列が公開されている。構造上の理由で変異を加えている以外はオリジナルの配列のようだ(そりゃそうか)。
モデルナ